Ciao e benvenuto anzitutto. In parole povere ogni pedale per chitarra è progettato per lasciar passare alcune frequenze ed altre no, ecco perchè usandoli con il basso si ha la perdita di frequenze che stanno sotto una certa soglia. Un buon punto di partenza è cambiare il condensatore in entrata che attua il primo "taglio" di frequenze e in seguito anche altri condensatori lungo il resto del circuito, seguendo questo schema
http://www.godiksennet.com/images/sch/DS1PG2.jpg
prova a cambiare i seguenti componenti: C1 da 47n a 0.1uf, C2 da 470n a 1uf, C3 da 47n a 0.1uf, C5 da 68n a 0.1uf, C8 da 470n a 1uf, C11 da 22n a 47n, C12 da 100n a 0.1uf, C13 da 47n a 0.1uf.
Ti consiglio di provare sempre il pedale dopo il cambio di ogni componente.

Quando riesci a scrutare bene in una direzione vedi ovunque. Attraverso la comprensione di una cosa puoi intuirne diecimila